员工旷工按月标准20%扣基本工资、岗位工资和绩效工资是否合法，需根据具体情况及公司的规章制度来判断。以下是详细分析：

一. 法律对扣工资的规定

1. 扣款合法性：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位有权对旷工员工进行一定的经济处罚，但处罚必须在合法、合理的范围内，且不能违反法律法规的强制性规定。扣款的具体数额和方式应由用人单位的规章制度明确，并应确保不侵犯员工的合法权益。
2. 扣款比例与限额：法律并未明确规定旷工扣款的具体比例或限额。因此，按月标准20%扣基本工资、岗位工资和绩效工资是否合法，关键在于这一扣款比例是否经过公司规章制度明确规定，并且是否合理。

二. 公司规章制度的重要性

1. 规章制度的作用：公司规章制度是用人单位管理员工的重要依据。如果规章制度中明确规定了旷工扣款的比例和方式，并且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照规章制度进行扣款是合法的。
2. 规章制度的合法性：用人单位在制定规章制度时，应确保其内容合法、合理，且经过民主程序制定并公示或告知员工。如果规章制度本身存在违法或不合理之处，那么依据该规章制度进行的扣款行为也将面临合法性质疑。

三. 具体判断

1. 查看规章制度：首先，应查看用人单位的规章制度中是否有关于旷工扣款的具体规定，以及该规定是否合法、合理。
2. 评估扣款合理性：其次，应评估按月标准20%扣基本工资、岗位工资和绩效工资这一比例是否合理。这需要考虑员工的旷工天数、对公司造成的影响以及员工的收入状况等因素。
3. 综合判断：最后，应综合以上因素来判断扣款行为是否合法。如果规章制度中有明确规定且合理，那么扣款行为可能是合法的；如果规章制度中无明确规定或规定不合理，那么扣款行为可能面临合法性质疑。

我建议：员工在面对旷工扣款问题时，应首先查看用人单位的规章制度，了解扣款的具体规定和依据。如果认为扣款行为不合法或不合理，可以向用人单位提出异议或向劳动监察部门投诉。同时，用人单位在制定规章制度时也应确保其内容合法、合理，并严格按照规章制度进行管理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。