国企试用期之所以有三个月和六个月的不同，主要是根据劳动合同期限的长短来确定的。具体分析如下：

一. 试用期与劳动合同期限的关系

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条，劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。
2. 应用解释：国企在与员工签订劳动合同时，会根据合同期限的不同来约定试用期的长短。如果劳动合同期限较短，如一年以内，试用期则相应较短，不得超过二个月。而如果劳动合同期限较长，如三年以上，试用期则可以约定为最长六个月。

二. 试用期约定的合理性

1. 试用期目的：试用期是用人单位和劳动者相互了解、协商的过程，也是用人单位考察劳动者是否适合岗位的重要时期。因此，根据劳动合同期限的长短来约定试用期的长短，既保障了用人单位的合法权益，也体现了对劳动者的尊重和保护。
2. 避免滥用试用期：法律规定试用期的最长期限，是为了防止用人单位滥用试用期，损害劳动者的权益。通过明确试用期的长短与劳动合同期限的关系，可以确保试用期的约定在合理范围内。

综上所述，国企试用期之所以有三个月和六个月的不同，主要是根据劳动合同期限的长短来确定的，这是符合《中华人民共和国劳动合同法》的规定的。我建议劳动者在签订劳动合同时，应仔细了解试用期的约定，确保自己的权益得到保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。