赡养老人扣款少扣了在年终结算能申诉回来。针对这一问题，可以从以下几个方面进行分析：

一. 申诉途径

1. 个人所得税APP更正申报：如果赡养老人扣款少扣是由于填报错误导致的，可以通过个人所得税APP进行更正申报。具体操作为：登录手机个人所得税APP后，进入专项附加扣除填报界面，选择查询年度，查看并修改“赡养老人”扣除信息填报记录。

2. 税务部门申诉：如果更正申报后仍存在问题，或者认为税务部门在处理过程中存在错误，可以向当地税务部门申诉。税务部门将会对申诉情况进行调查核实，并依法处理。

二. 申诉材料准备

在进行申诉时，应准备以下相关材料：

1. 身份证明：如身份证复印件，以证明申诉人的身份。

2. 相关证明文件：如与赡养老人相关的证明文件（如亲属关系证明）、个人所得税缴纳记录、工资条等，以证明赡养老人扣款少扣的事实和金额。

3. 申诉理由及证据材料：详细陈述申诉理由，并提供相关证据材料支持申诉主张。

三. 申诉流程

1. 提交申诉材料：将准备好的申诉材料提交给税务部门或相关申诉机构。

2. 调查核实：申诉机构在收到材料后，将进行调查核实工作，以确认赡养老人扣款少扣的具体情况。

3. 处理与反馈：一旦调查确认存在问题，申诉机构将依法对责任方进行处理，并将处理结果反馈给申诉人。

四. 注意事项

1. 及时申诉：发现赡养老人扣款少扣后，应及时进行申诉，以避免错过申诉时效。

2. 保留相关证据：在申诉过程中，应保留好相关证据材料，以便在需要时提供证明。

我的建议：如果您发现赡养老人扣款少扣，可以按照上述流程进行申诉。同时，建议您在申诉前仔细核对个人所得税APP中的填报记录，确保填报信息的准确性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。