针对您提出的问题，关于企业人员未签劳动协议应如何赔偿，以及赔偿是基于应发工资还是实发工资，以下是我的详细解答：

首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条的明确规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资作为补偿。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，确保劳动关系的合法性和稳定性。

在赔偿的计算上，这里的“工资”是基于劳动者的应得工资来计算的。应得工资不仅仅包括实际发放到劳动者手中的工资，它还包括了各种奖金、津贴、补贴等属于工资性质的收入。换句话说，赔偿的金额应该是劳动者在正常工作情况下能够获得的全部货币性收入的两倍。

举个例子来说，如果某员工的基本工资是3000元，每月还有1000元的绩效奖金，那么他的应得工资就是4000元。如果公司未在规定时间内与他签订书面劳动合同，那么在计算未签合同的二倍工资差额时，就应以每月4000元作为计算基数。

此外，还需要注意的是，对于工资结构比较复杂的劳动者，比如包含绩效奖金、业务提成等不固定项目的情况，通常会取一段时间内的平均工资来计算，以更公平地反映其工资水平。同时，如果劳动者的工资明显高于当地上年度职工月平均工资的三倍，可能会受到一定限制，并且如果当地有具体法规或政策对计算基数有特别规定，那么应遵循当地的规定。

最后，我要提醒您的是，劳动者在主张未签订劳动合同的二倍工资时，需要注意仲裁时效的限制，通常为一年，从知道或者应当知道权利被侵害之日起计算。同时，劳动者还应收集能够证明劳动关系和工资数额的证据，如工资条、银行流水、工作证、考勤记录等，以便在必要时进行举证。

综上所述，企业未与劳动者签订书面劳动合同需承担法律责任，支付二倍工资作为补偿，且该补偿是基于劳动者的应得工资来计算的。希望这个解答能够对您有所帮助。