对于同一项目出现两个中标单价的情况，应首先核查招标文件、投标文件以及中标通知书，确定中标单价的确切来源，并与招标方、中标方进行协商，以明确结算单价，避免纠纷。具体分析如下：

一. 核查相关文件

1. 招标文件：根据《中华人民共和国招标投标法》第十九条，招标文件应当包括投标报价要求等所有实质性要求和条件。首先，需核查招标文件中是否对投标报价有明确规定，特别是是否允许存在多个中标单价或备选报价。
2. 投标文件：投标人应按照招标文件的要求编制投标文件，并对招标文件的实质性要求和条件作出响应（《中华人民共和国招标投标法》第二十七条）。检查投标文件，看投标人是否按照招标文件要求提交了报价，以及是否存在误报或漏报的情况。
3. 中标通知书：中标通知书是确认中标结果的正式文件。需核查中标通知书中明确的中标单价是哪个，以及是否有关于结算单价的特别说明。

二. 与招标方、中标方协商

1. 与招标方协商：如果招标文件中未明确规定如何处理多个中标单价的情况，应与招标方进行沟通，了解其对此事的立场和意见，共同商讨解决方案。
2. 与中标方协商：同时，也需与中标方进行协商，了解其报价的依据和理由，以及是否愿意按照某个特定的单价进行结算。

三. 确定结算单价

1. 以招标文件为准：如果招标文件中明确规定了如何处理多个中标单价的情况，应按照招标文件的规定执行。
2. 协商一致：如果招标文件中未明确规定，且招标方和中标方能够就结算单价达成一致意见，则应按照协商结果执行。
3. 依法裁决：如果无法协商一致，且争议较大，可能需要通过法律途径解决，如申请仲裁或提起诉讼。

我建议，在处理此类问题时，应充分尊重招标文件的规定，同时积极与招标方和中标方进行沟通协调，以寻求合理、公平的解决方案。如有进一步需要，您可以继续咨询我。