如遇到真实交易却收到虚开发票的情况，企业应积极配合税务检查，并采取相应措施证明业务真实性，以便进行税前扣除。具体处理方式如下：

一. 及时补开、换开发票

• 企业取得不合规发票时，若支出真实且已实际发生，应要求对方补开、换开发票或其他外部凭证。补开、换开后的发票或其他外部凭证若符合规定，则可作为税前扣除凭证。
• 注意时间限制：若发票对应年度的企业所得税汇算清缴期已结束，企业应在被税务机关告知之日起60日内补开、换开符合规定的发票或其他外部凭证。

二. 无法补开、换开发票时的处理

• 若因对方注销、撤销、被吊销营业执照、被税务机关认定为非正常户等特殊原因，确实无法补开、换开发票或其他外部凭证，企业可凭以下资料证实支出真实性后，其支出仍允许税前扣除：
  1. 无法补开、换开发票原因的证明资料（如工商注销、机构撤销、列入非正常经营户、破产公告等）。
  2. 相关业务活动的合同或协议。
  3. 采用非现金方式支付的付款凭证。
  4. （如适用）货物运输的证明资料。
  5. （如适用）货物入库、出库内部凭证。
  6. 企业会计核算记录以及其他相关资料。
• 注意：其中第一项至第三项为必备资料。

三. 未能提供有效证明的处理

• 若企业在税务机关规定的期限内未能补开、换开符合规定的发票或其他外部凭证，且未能提供相关资料证实其支出真实性，则相应支出不得在发生年度税前扣除。
• 此时，企业应在税务机关规定的期限内调增发生年度的企业所得税应纳税所得额，并进行企业所得税更正申报。

我建议企业在收到虚开发票的通知后，应尽快与对方沟通并要求补开或换开发票，同时保留好所有相关证据和资料，以便在税务检查时能够证明业务的真实性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。