老板诈骗并将钱打到员工卡里，员工应积极配合调查，说明情况，并退还相关款项，以避免承担不必要的法律责任。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 员工的法律责任

1. 无辜涉及：如果员工对老板的诈骗行为并不知情，且没有参与诈骗活动，那么员工在法律上通常不需要承担刑事责任。但是，员工需要积极配合公安机关的调查，说明自己只是被动接收了款项，并未参与诈骗。
2. 退款义务：虽然员工可能并未参与诈骗，但如果款项确实打入了员工的账户，员工有义务将这部分款项退还给受害者或公安机关指定的账户。这是为了避免员工因不当得利而承担民事责任。

二. 员工的应对措施

1. 保留证据：员工应妥善保留所有与老板诈骗行为相关的证据，如聊天记录、转账记录等。这些证据有助于证明员工的清白，以及员工并未参与诈骗活动。
2. 及时报案：一旦发现自己被卷入诈骗案件，员工应立即向公安机关报案，并详细说明情况。这有助于公安机关及时开展调查，澄清事实。
3. 配合调查：在公安机关调查过程中，员工应积极配合，如实陈述事实，提供所需证据。这有助于公安机关尽快查明案件真相，还员工清白。
4. 咨询律师：如果员工对案件处理存在疑虑或担忧，可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和应对策略。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗公私财物数额较大的，将受到刑事处罚。但这一规定主要针对的是实施诈骗行为的人，对于无辜涉及的员工，只要能够证明自己的清白，通常不需要承担刑事责任。
• 同时，员工应明确自己只是被动接收了款项，并未参与诈骗活动。如果款项确实打入了员工的账户，员工应尽快将款项退还给受害者或公安机关指定的账户，以避免承担不当得利的民事责任。

综上所述，如果老板诈骗并将钱打到员工卡里，员工应积极配合调查，说明情况，并退还相关款项。如有进一步需要，您可以继续咨询我。