在政府代建工程中，若未办理相关证件，如建设工程规划许可证，责任应由负责该项目的建设单位或代建单位承担。具体分析如下：
一. 责任主体分析
- 建设单位或代建单位的责任：在政府代建工程中，建设单位或代建单位是项目的主要责任主体。根据《中华人民共和国城乡规划法》第四十条，建设单位或个人在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物等工程建设时，应向城乡规划主管部门申请办理建设工程规划许可证。因此，若未办理该证，建设单位或代建单位应承担相应的法律责任。
二. 法律依据与处罚
- 《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条：未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设。尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，并处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
三. 案例说明
- 例如，在某政府代建工程中，若建设单位或代建单位未办理建设工程规划许可证便擅自开工，根据上述法律规定，他们将面临责令停止建设、罚款等处罚。若项目无法采取改正措施消除对规划实施的影响，还可能被限期拆除或没收实物及违法收入。
我建议，在政府代建工程中，建设单位或代建单位应严格遵守相关法律法规，确保在开工前办理好所有必要的证件和手续，以避免不必要的法律责任和经济损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。