对于两人合作的店客户丢失的情况，应首先明确责任归属，并基于合作关系与法律规定，协商出合理的处理方案。

一. 明确责任归属

1. 分析丢失原因：首先，需要详细分析客户丢失的具体原因，是由于服务不佳、产品质量问题、竞争对手影响，还是其他外部因素导致的。这一步是确定责任归属的基础。
2. 划分责任：根据分析结果，判断是否为合作双方的共同责任，还是某一方的单独责任。例如，如果是因为某一方提供的产品或服务存在问题导致客户丢失，那么该方应承担主要责任。

二. 协商处理方案

1. 基于合作关系：两人合作开店，应本着合作共赢的原则，共同面对客户丢失的问题。双方应坐下来坦诚沟通，共同商讨如何应对客户丢失带来的挑战。
2. 考虑法律规定：虽然《中华人民共和国发票管理办法》主要关注的是发票的合法使用和管理，与客户丢失的直接处理关系不大，但双方在处理客户丢失问题时，应遵守相关法律法规，不得采取违法手段。例如，不得通过恶意诋毁、造谣传谣等方式来争夺客户。
3. 制定具体措施：根据责任归属和合作原则，双方可以共同制定一系列具体措施来挽回客户、提升服务质量、增强竞争力。这些措施可能包括改进产品、提升服务、加强市场营销等。

三. 执行与监督

1. 执行方案：双方应严格按照协商好的处理方案执行，确保各项措施得到有效落实。
2. 监督与调整：在执行过程中，双方应相互监督，及时发现问题并进行调整。如果某一方未能按照约定履行责任，另一方有权要求其改正或承担相应的违约责任。

我建议，在处理两人合作店客户丢失的问题时，双方应保持冷静和理性，以合作共赢为目标，共同面对挑战。通过明确责任归属、协商处理方案、执行与监督等步骤，可以有效解决客户丢失的问题，并维护合作关系的稳定和发展。如有进一步需要，您可以继续咨询我。