面对工商变更时股东不配合的情况，我们可以采取以下措施来妥善处理：

结论前置

在股东不配合工商变更时，首先应尝试通过沟通了解原因并寻求解决方案。若沟通无果，可依据公司章程或《公司法》的规定，通过召开股东会形成有效决议，或依法向法院提起诉讼，要求股东履行协助变更的法定义务。

具体措施

1. 沟通协商：

   • 首先，应尝试与不配合的股东进行深入的沟通，了解其不配合的具体原因，看是否存在误解或可以协商解决的难题。
   • 通过解释工商变更的必要性、对公司及股东的长远利益，以及变更可能带来的积极影响，争取股东的理解和支持。

2. 依据公司章程：

   • 查阅公司章程，看是否有关于股东变更事宜的明确规定。
   • 若章程中有明确条款，应严格按照章程规定执行，包括通知方式、表决程序等。

3. 召开股东会：

   • 若沟通无果，且公司章程或《公司法》允许，可召集全体股东召开股东大会。
   • 在会议上就工商变更事项进行表决，确保会议程序合法，表决结果有效。
   • 形成的股东会决议具有法律效力，可作为变更工商登记的重要依据。

4. 法律途径：

   • 若股东会决议仍无法解决问题，或股东无正当理由拒不配合，可考虑向法院提起诉讼。
   • 提起诉讼前，应做好充分的准备工作，包括收集相关证据（如公司章程、股东会决议、股权转让协议等），以证明变更的合法性与必要性。
   • 请求法院判决该股东必须履行协助变更的法定义务，或确认股东会决议的效力。

5. 预防与建议：

   • 为避免类似问题再次发生，建议在公司章程中明确股东签字、表决方式及通过比例等相关规定。
   • 加强股东之间的沟通与合作，建立有效的决策机制，确保公司运营的顺畅和稳定。

法律依据

• 《中华人民共和国公司法》第七十一条规定了股东之间股权转让的相关事宜，包括股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，以及其他股东在同等条件下的优先购买权等。
• 公司章程作为公司内部的重要法律文件，对股东的权利与义务、公司的经营管理等事项具有明确的约定和规定。

综上所述，面对工商变更时股东不配合的情况，我们应首先尝试通过沟通协商解决问题。若沟通无果，可依据公司章程或《公司法》的规定，通过召开股东会或采取法律途径来妥善处理。