民办非企业单位在有司法案件的情况下，一般是可以更换法人的，但需遵循一定的程序和规定。

首先，我们要明确的是，民办非企业单位的法人更换并非随意进行，而是需要符合相关法律法规的规定，并经过一定的程序。在有司法案件的情况下，更换法人可能会受到一些限制或影响，但并不意味着完全不能更换。

具体来说，如果民办非企业单位涉及司法案件，那么在更换法人时，需要特别注意以下几点：

1. 案件性质与影响：要分析司法案件的性质、涉及的法律关系以及可能对单位造成的影响。如果案件涉及的是单位的民事责任或刑事责任，那么更换法人可能需要经过相关部门的批准或同意，以确保案件的顺利处理和法律责任的承担。

2. 法人更换程序：按照《民办非企业单位登记管理暂行条例》等相关法律法规的规定，民办非企业单位的法人更换需要履行一定的程序，包括提交相关材料、经过审批等。在有司法案件的情况下，这些程序可能更加严格或复杂。

3. 法律后果与责任：更换法人后，原法人所承担的法律责任并不会因此而自动转移。新法人需要了解并承担单位可能存在的法律风险和责任，包括正在进行的司法案件。

综上所述，民办非企业单位在有司法案件的情况下是可以更换法人的，但需要遵循相关法律法规的规定，并经过一定的程序。同时，新法人需要充分了解并承担单位可能存在的法律风险和责任。如果您在具体操作中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。