解除劳动关系赔偿合同中不可以约定不得申请公积金仲裁。下面我将从几个方面来详细解释这个结论：

1. 法律原则：根据法律原则，任何试图剥夺或限制劳动者合法权利的条款都是无效的。公积金是劳动者依法享有的权益，申请公积金仲裁是劳动者维护自身权益的合法途径。因此，在解除劳动关系赔偿合同中约定不得申请公积金仲裁，违反了法律原则，该条款无效。

2. 合同自由与限制：虽然合同是双方自愿达成的，但合同内容必须遵守法律法规，不得违反公序良俗。对于涉及劳动者基本权益的事项，如公积金，法律有明确的保护规定。因此，即使双方在合同中约定了不得申请公积金仲裁，这一约定也因违反法律规定而无效。

3. 公积金的法定性：公积金是由国家法律规定的，用人单位和劳动者必须依法缴纳。公积金的缴纳和使用受到法律的严格监管，任何试图通过合同约定来规避法律义务的行为都是不被允许的。

4. 仲裁的独立性：仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，具有独立性和公正性。劳动者有权根据法律规定申请仲裁，以解决与用人单位之间的争议。解除劳动关系赔偿合同中的任何条款都不能剥夺或限制劳动者的这一权利。

综上所述，解除劳动关系赔偿合同中不可以约定不得申请公积金仲裁。如果合同中包含了这样的条款，该条款是无效的，劳动者仍然有权依法申请公积金仲裁来维护自己的权益。如果你在这方面还有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。