在二审中，对于一审判决正确的部分可以判决维持，对其他认定事实不清的部分可以裁定撤销原判、发回原审人民法院重新审判，或者直接改判。下面我详细解释一下：
根据我国《刑事诉讼法》的相关规定，第二审人民法院对不服第一审判决的上诉、抗诉案件，经过审理后，应当按照下列情形分别处理：
原判决认定事实和适用法律正确、量刑适当的，应当裁定驳回上诉或者抗诉，维持原判。也就是说，如果一审判决在事实和法律适用上都没有问题，量刑也适当，那么二审法院就会维持原判。
原判决认定事实没有错误，但适用法律有错误，或者量刑不当的，应当改判。这种情况下，虽然一审认定的事实没有问题，但在法律适用或量刑上出现了错误，二审法院会直接改判。
原判决事实不清楚或者证据不足的，可以在查清事实后改判；也可以裁定撤销原判，发回原审人民法院重新审判。这里就涉及到了你提到的“认定事实不清”的情况。二审法院可以选择自己查清事实后改判，也可以选择发回重审，让一审法院重新审理。
综上所述，二审法院在处理上诉、抗诉案件时，会根据一审判决的情况作出不同的处理。对于一审判决正确的部分，会维持原判；对于认定事实不清的部分，可以选择改判或者发回重审。如果你还有其他关于二审程序的问题，可以直接向我咨询。