企业改制认定的连续工龄在办理退休时通常是会被承认的。具体分析如下：

在企业改制过程中，对于员工的连续工龄认定，通常遵循国家相关政策规定。这些规定旨在保障员工的合法权益，确保他们在改制后的企业中能够继续享有应有的工龄待遇。因此，在办理退休时，企业改制认定的连续工龄一般会被承认，并作为计算退休金的重要依据之一。

具体来说，根据国家相关政策，对于在企业改制前已经形成的连续工龄，只要符合相关规定，如员工在改制前后均在同一企业或相关企业中连续工作，且未出现中断或违规情况，那么这段工龄在改制后应继续被承认。在办理退休时，这段工龄将被计入员工的总工龄中，从而影响退休金的计算。

当然，也存在一些特殊情况。例如，如果员工在企业改制过程中因某些原因（如违纪、辞职等）导致工龄中断或不被认定，那么这段工龄在办理退休时可能不会被承认。因此，在具体情况下，还需要根据员工的个人档案和相关政策规定进行具体判断。

总之，企业改制认定的连续工龄在办理退休时通常是会被承认的。但具体承认情况还需根据员工的个人档案和相关政策规定进行确定。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。