虚开增值税专用发票罪国家税款损失的判断主要依据虚开的税款数额以及该行为对国家税款造成的实际损失来确定。以下是对此问题的详细解答：

一、判断标准

1. 基本立案标准

   • 根据我国《中华人民共和国刑法》及《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》，如果虚开增值税专用发票的税款数额在一万元以上，或者该行为导致国家税款被骗数额在五千元以上，即满足基本的立案追诉条件。

2. 量刑情节的立案标准

   • 当虚开的税款数额达到十万元以上，或者因此导致国家税款被骗取五万元以上的，被视为“虚开的税款数额较大或有其他严重情节”。
   • 若虚开的税款数额高达五十万元以上，或者因此导致国家税款被骗取三十万元以上的，则被认定为“虚开的税款数额巨大或有其他特别严重情节”。

二、国家税款损失的具体判断

• 直接损失：直接因虚开增值税专用发票而导致的国家税款减少，如虚开的发票上载明的税额，这部分税额本应上缴国库但因虚开行为而流失。
• 间接损失：可能包括因虚开行为引发的连锁反应，如因虚开导致的税收征管成本增加、税收秩序混乱等，但这些间接损失在计算时可能较为复杂，且不一定全部计入国家税款损失。

三、法律后果

• 刑事责任：根据虚开税款数额和情节的严重性，犯罪者可能面临不同年限的有期徒刑、拘役、罚金甚至没收财产等刑罚。
• 民事责任：在某些情况下，犯罪者可能还需要承担民事赔偿责任，以弥补因其行为给国家造成的税款损失。

四、建议与总结

• 增强法律意识：企业和个人应严格遵守税法规定，避免触碰法律红线。
• 及时咨询专业法律人士：在遇到相关问题时，应尽快咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。
• 积极补缴税款：对于已经发生的虚开行为，应积极配合税务机关进行查处，并主动补缴税款，以减轻法律后果。

综上所述，虚开增值税专用发票罪国家税款损失的判断是一个综合考量多方面因素的过程，包括虚开的税款数额、行为方式、造成的实际损失等。在处理此类案件时，应严格遵循法律规定，确保判决的公正性和合理性。