针对“员工不配合做汇算清缴怎么办”这一问题，首先我们要明确，汇算清缴是员工个人的税务义务，不进行汇算清缴可能会面临一系列严重的后果。以下是我作为律师给出的详细分析和建议：

明确结论： 员工不配合做汇算清缴，将可能面临经济损失、行政处罚以及信用受损等后果。作为雇主或相关管理人员，应当积极劝导员工履行这一义务，并告知其可能面临的法律风险。

详细分析：

1. 经济损失：

   • 若员工经汇算清缴后需补税但未在规定时间内完成，将产生滞纳金，随时间推移，滞纳金将持续累积，增加经济负担。
   • 若员工可退税但未进行汇算清缴，将主动放弃退税款，造成直接经济损失。

2. 行政处罚：

   • 根据税收征收管理法，不进行纳税申报或不缴、少缴应纳税款的，税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以罚款。情节严重时，还可能构成逃税罪，需承担刑事责任。

3. 信用受损：

   • 税务部门会将纳税情况纳入个人信用信息系统。不进行汇算清缴将影响个人信用，可能在贷款、信用卡申请、租房、求职等场景中面临阻碍。

建议措施：

1. 加强沟通与教育：

   • 与员工进行面对面沟通，明确告知其汇算清缴的重要性和不履行的后果。
   • 可以通过内部培训或外部专家讲座等形式，提高员工对税务法规的认识和重视程度。

2. 提供必要的协助：

   • 对于不熟悉汇算清缴流程的员工，可以提供必要的指导和帮助，如提供操作指南、安排专人协助等。
   • 鼓励员工咨询专业税务人员或律师，以确保其正确履行税务义务。

3. 建立激励机制：

   • 可以考虑将汇算清缴与员工绩效、奖励等挂钩，激励员工主动履行税务义务。

4. 依法处理：

   • 若员工仍拒不配合进行汇算清缴，作为雇主或相关管理人员，应当依法向税务机关报告，并配合税务机关进行处理。

综上所述，员工不配合做汇算清缴将面临多重严重后果。作为雇主或相关管理人员，应当积极采取措施劝导员工履行税务义务，以避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。