如果买了商品房后开发商跑路了，办理房产证确实会面临一些困难，但并非无法解决。以下是一些具体的步骤和建议，希望能对您有所帮助：

首先，您需要收集并保存好所有与购房相关的证据，包括购房合同、付款凭证、发票以及入住通知等。这些证据在后续的维权和办理房产证过程中都将起到至关重要的作用。

其次，您可以向当地的住建部门了解该项目的具体情况，包括是否已经完工并通过验收，只是因开发商原因未能办理房产证。如果项目已经符合办理房产证的条件，您可以考虑通过法律途径要求开发商履行办证义务。

同时，您也可以联合其他业主组成维权小组，推选代表与相关部门进行沟通。这样可以更有效地推动政府督促开发商履行办证义务，或者在开发商已无法履行的情况下，协调相关部门为业主开辟办证的绿色通道。

如果上述方法均无法解决问题，您可以考虑向法院提起诉讼，要求开发商承担违约责任并协助办理房产证。在法院判决后，您可以依据生效的判决申请强制执行，凭借法院的文书办理房产证。

另外，如果开发商已经注销，您可以通过工商部门获取开发商注销的相关证明，再予以办理房产证。在这个过程中，您可能需要提供已备案的商品房买卖合同、契证、房屋维修基金收据、初始登记批复以及商品房预售许可证等文件。

总的来说，虽然开发商跑路会给办理房产证带来一定的困难，但只要您保存好相关证据，积极与相关部门沟通，并通过法律途径维护自己的权益，就一定能够解决这个问题。