在办完房产证后，如果购房合同被收走，您不必过于担心，但需要根据不同情况采取相应措施来确保自身权益。以下是对此问题的详细分析和建议：
一、明确合同被收走的主体及原因
银行抵押备案：
- 如果您是通过贷款购房，银行在您拿到房产证后可能会收走购房合同作为抵押备案资料。这是银行为了保障其债权安全而采取的正常流程。您可以向银行咨询合同留存的具体规定，并要求银行出具收条，注明合同的相关信息，如合同编号、收走时间等。
房管局或开发商存档：
- 房管局在办理房产证过程中，可能会收取一份购房合同用于归档管理，以确保产权登记信息的准确性和合法性。同时，开发商在协助您办理完房产证后，也可能收回部分合同原件以完善自身的档案管理。您可以向房管局或开发商申请查询合同存档情况，并获取加盖公章的合同复印件，该复印件具有同等法律效力。
二、确保合同安全与备份
事先复印合同：
- 在办理房产证前，建议您事先复印购房合同，并妥善保管复印件。这样，即使原件被收走，您仍有复印件作为参考和证明。
留存其他证据：
- 除了合同复印件外，您还可以通过拍照、录像等方式留存购房相关的其他证据，如付款凭证、沟通记录等。这些证据在日后可能对您维护自身权益有所帮助。
三、处理合同未归还的应对措施
沟通协商：
- 如果合同被非正常收走或您对合同被收走存在疑虑，首先应尝试与收走合同的一方（如开发商、银行等）进行沟通，了解其收走合同的具体原因和用途，并要求返还合同或提供合同复印件。
寻求第三方调解：
- 如果沟通无果，您可以寻求房地产管理部门、消费者协会等第三方机构的调解。这些机构通常具有专业的调解能力和经验，能够帮助您解决问题。
法律途径：
- 如果以上方法均无法解决问题，您有权向法院提起诉讼，要求收走合同的一方归还合同或提供法律救济。在诉讼过程中，您需要提供充分证据支持自己的主张，如合同复印件、沟通记录等。
四、补办购房合同的流程与效力
- 如果合同遗失或无法找回，您可以向开发商或房管局申请补办购房合同。具体流程和所需材料因地区而异，建议您提前向当地相关部门咨询。
- 补办时，相关机构一般会提供留底的一份合同的原件或复印件，并在复印件上盖章确认。该复印件具有与原件同等的法律效力，可以作为您维护自身权益的依据。
总结与建议
房产证和购房合同都是房产交易中的重要法律文件，需妥善保管。在合同被收走时，您应首先明确收走主体及用途，并留存复印件以备不时之需。如遇疑虑或纠纷，应及时沟通并寻求专业帮助以维护自身权益。同时，建议您在未来的房产交易中更加谨慎，确保所有重要文件都得到妥善保管和备份。