针对您提出的“2025年个人所得税申请退税不通过怎么办”的问题，以下是一些详细的解答和建议：
首先，您需要仔细查看税务机关给出的审核不通过的具体原因。常见的原因之一可能是“年度汇算时申报的劳务报酬总收入少于代开发票总金额”。针对这种情况，您可以采取以下措施：
- 核实收入情况：
- 如确实未取得相关收入，您可以对发票进行冲红或作废处理，并确保您的申报数据与实际情况相符。
- 如已取得相关收入但支付方未代扣代缴税款，您需要通过自增收入的方式将这部分收入汇总进综合所得汇算收入内，并再次进行退税申请。
其次，如果您的退税申请被驳回，并且系统提示您需要按照审核意见更正申报并修改数据，您应该：
更正申报数据：
- 通过个税APP或相关税务平台，根据审核意见仔细修改您的申报数据。这可能包括四项综合所得收入合计、费用合计、免税收入、专项扣除、专项附加扣除、其他扣除、准予扣除的捐赠额、减免税额以及已缴税额等。
- 确保所有修改的数据项都是准确无误的，并且与您的实际情况相符。
重新提交退税申请：
- 在完成更正申报后，您可以在个税APP上重新发起退税申请。
- 请注意，如果审核不通过超过两次，您可能需要更加仔细地核对您的申报数据，并确保所有信息都是正确的。
最后，如果您在更正申报和修改数据后仍然无法成功申请退税，或者对退税流程有任何疑问，您可以：
- 联系税务部门：
- 拨打12366纳税服务热线，咨询专业的税务人员，他们将为您提供详细的指导和帮助。
- 您也可以前往当地的办税服务厅，面对面地咨询税务人员，并办理相关的退税手续。
综上所述，当您的个人所得税退税申请不通过时，您需要仔细查看审核意见，根据意见更正申报数据，并重新提交申请。如果遇到困难或疑问，及时联系税务部门寻求帮助是明智的选择。希望这些解答和建议能对您有所帮助！