个人所得税专项附加扣除既可以选择按月扣除，也可以选择按年扣除，具体选择哪种方式更合适，主要取决于您的实际情况和扣除项目。

如果您是工资、薪金所得的纳税人，通常建议选择按月扣除。这样，您可以在每月预扣预缴税款时及时享受专项附加扣除带来的减税优惠，减轻当月的个税负担，增加到手工资。您只需填写专项附加扣除信息表并提交给任职受雇单位，单位会每月在计算应纳税所得额时相应扣除。

然而，对于无工资、薪金所得，仅取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费等收入的纳税人，或者忘记月度填报专项附加扣除信息的纳税人，以及特定专项附加扣除项目（如子女教育、继续教育、房贷利息支出等）通常是按年计算的，可能更适合选择按年扣除。这样可以在年度汇算清缴时，根据全年实际情况进行更精确的扣除和调整，确保税收公平。

此外，对于大病医疗支出这一特殊扣除项目，它是在次年3月1日至6月30日通过汇算清缴进行扣除的，但实际上是基于上一年度每月的医疗费用累计计算的，因此也倾向于按年扣除。

总的来说，选择按月扣除还是按年扣除，需要您根据自己的实际情况和扣除项目来做出决定。如果您对个税政策或扣除方式有疑问，建议咨询专业税务人员，以确保正确理解和应用税收政策，避免潜在的税务风险。