专项附加扣除既可以按年度算，也可以按月或按季度累计扣除，具体取决于纳税人的实际情况和选择。

一、按月或按季度累计扣除

对于取得工资、薪金等连续性收入的纳税人，通常建议按月或按季度累计扣除专项附加扣除。纳税人需填写专项附加扣除信息表并提交给任职受雇单位，单位在每月或每季度发放工资时，会根据纳税人当月或当季可享受的专项附加扣除项目及金额，在计算预扣预缴税款时进行相应扣除。

二、按年度汇算清缴时扣除

对于以下情况的纳税人，可选择按年汇算清缴时扣除专项附加扣除：

1. 取得经营所得且没有综合所得的纳税人；
2. 纳税年度内未享受或未足额享受专项附加扣除的纳税人，如年度中间才满足扣除条件或收入不稳定等。

纳税人可在次年3月1日至6月30日内，办理综合所得汇算清缴时，向税务机关报送专项附加扣除相关信息，实现全年扣除。

三、注意事项

1. 纳税人应根据自身实际情况和所得类型，合理选择扣除方式；
2. 若年度中间收入或扣除情况发生变化，应及时更新专项附加扣除信息；
3. 纳税人应保留好相关凭证和资料，以备税务机关核查。

综上所述，专项附加扣除的扣除方式灵活多样，纳税人可根据自身情况选择最适合的方式，并确保信息的准确性和完整性，以避免不必要的税务风险。如有更多疑问或需要详细咨询，请直接向我提问。