关于土地增值税法清算是应由总公司还是项目地负责的问题，这主要取决于具体的组织结构和税务管理安排。一般来说，土地增值税的清算主体通常是项目公司或项目所在地的分支机构，而不是总公司。以下是对这一结论的详细解释：
税务管理原则：土地增值税是针对土地使用权转让及地上建筑物等附着物产权转移所征收的一种税。根据税务管理的属地原则，相关税务事宜通常由项目所在地的税务机关进行管理和清算。
项目公司或分支机构的角色：在实际操作中，项目公司或项目所在地的分支机构通常负责具体的项目开发、销售和税务申报工作。因此，它们也是土地增值税清算的直接责任主体。
总公司的角色：总公司通常负责整体的战略规划、资金管理和财务监督，但并不直接参与项目的日常运营和税务清算。然而，总公司可能会对项目公司或分支机构的税务清算工作提供指导和支持。
特殊情况：在某些特殊情况下，如果总公司与项目公司或分支机构之间有特殊的税务安排或协议，可能会影响土地增值税的清算主体。但这种情况相对较少见，且需要根据具体的税务规定和合同条款来确定。
综上所述，土地增值税的清算主体通常是项目公司或项目所在地的分支机构。如果您在实际操作中遇到具体问题或疑问，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的解答和建议。