医疗机构配置试剂，如果是指医疗机构配制制剂，那么根据《中华人民共和国药品管理法》以及国家卫生健康委办公厅的相关通知，应当经过以下机构批准：

医疗机构配制制剂应当经所在省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门批准，并取得相应的医疗机构制剂许可证。这是确保医疗机构所配制的制剂符合国家质量标准和安全要求的法律基础。在获得批准和许可证后，医疗机构方可合法地进行制剂的配制。

此外，对于仅应用传统工艺配制的中药制剂品种，法律规定了特殊的管理方式，即需要向所在地省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门进行备案，而非仅仅进行批准。这一规定旨在保护传统中医药的传承与发展，并确保其安全性和有效性得到适当的监管。

医疗机构在配制制剂的过程中，必须严格遵守相关的法律法规、操作规程以及质量标准和安全要求。如果未按照法定程序进行审批、备案或违反相关规定配制制剂，医疗机构将承担相应的法律责任。

综上所述，医疗机构在配置试剂（制剂）时，应当明确并遵守相关的审批或备案流程，确保患者用药的安全和有效。