同等基数的民营企业社保和职工社保退休工资在理论上应当是一样的，但实际操作中可能存在差异。以下是对这一结论的详细解释：

1. 理论基础：社保退休工资的计算主要依据的是个人的缴费基数、缴费年限、缴费比例以及当地的社保政策。在缴费基数相同的情况下，如果缴费年限、缴费比例以及当地社保政策也相同，那么无论是民营企业还是职工社保，其退休工资应当是相同的。

2. 实际操作差异：

   • 缴费年限：虽然基数相同，但不同个体的缴费年限可能不同，这会影响退休工资的总额。
   • 缴费比例：虽然理论上缴费比例应当相同，但在实际操作中，可能存在因政策调整、企业特殊规定等原因导致的缴费比例差异。
   • 政策差异：不同地区的社保政策可能存在细微差异，这些差异也可能影响退休工资的计算。
   • 企业补充养老保险：部分民营企业可能会为员工提供补充养老保险，这部分养老金的发放会影响退休后的总收入，但这并不属于社保退休工资的范畴。

3. 建议：为了确保退休工资的准确性和公平性，建议个人在缴纳社保时，仔细核对缴费基数、缴费年限和缴费比例，并了解当地的社保政策。如有任何疑问或发现不公平现象，应及时向当地社保部门咨询或投诉。

综上所述，虽然同等基数的民营企业社保和职工社保在理论上退休工资应当相同，但在实际操作中，由于缴费年限、缴费比例、政策差异以及企业补充养老保险等因素的影响，退休工资可能会存在差异。