智齿断了，牙根还在肉里面，这是一个比较常见的口腔问题。针对这种情况，处理方式主要取决于牙根的具体情况以及患者的身体状况。以下是一些建议：

首先，需要评估牙根的情况。如果牙根长度足够，且没有明显炎症，特别是单根牙，没有松动，那么可以考虑经过根管治疗后进行桩冠修复。这种方式可以保留牙根，并利用其进行牙齿的修复，恢复牙齿的功能和美观。

然而，如果牙根存在炎症、松动或者其他不适合进行桩冠修复的情况，那么可能需要考虑拔除牙根。在拔除牙根之前，医生通常会进行详细的检查，包括了解牙根的数目、大小、部位，并可能进行影像学检查，以确保手术的顺利进行。

拔除牙根的方法有多种，包括使用根钳夹住牙根进行拔除，或者使用根挺将牙根挺出。如果牙根断面较为锐利或者拔除困难，医生可能会选择使用翻瓣去骨法来拔除牙根。这种方法需要在牙根的颊侧牙龈作切口，翻瓣显露颊侧骨板，然后去骨暴露部分牙根，再用牙挺将牙根取出。

需要注意的是，拔除牙根是一项手术，存在一定的风险和并发症。因此，在进行手术之前，医生会与患者详细沟通，解释手术过程、风险以及术后注意事项。同时，患者也需要按照医生的嘱咐进行术后护理，以促进伤口的愈合和减少并发症的发生。

总的来说，智齿断了牙根还在肉里面，需要根据牙根的具体情况和患者的身体状况来选择合适的处理方式。建议尽快咨询专业的口腔医生进行评估和治疗，以确保口腔的健康和美观。