关于“招拍挂土地耕地占用税由谁交”的问题，以下是我的详细解答：
结论前置：招拍挂土地的耕地占用税缴纳主体需根据具体情况确定，可能由地方土地储备中心缴纳，也可能由受让土地者缴纳。但无论由谁缴纳，纳税义务发生时间均应遵循相关规定。
详细分析：
纳税主体：
- 在招拍挂土地过程中，耕地占用税的缴纳主体并非一成不变。根据实际操作，地方土地储备中心在征用耕地后，有两种处理方式：一种是由地方土地储备中心缴纳耕地占用税，作为土地开发成本费用的一部分，体现在招拍挂的价格当中；另一种方式是由受让土地者，即通过招拍挂方式取得土地的使用权人缴纳耕地占用税。
纳税义务发生时间：
- 根据《财政部、国家税务总局关于房产税、城镇土地使用税有关政策的通知》（财税〔2006〕186号）及相关规定，以出让或转让方式有偿取得土地使用权的，纳税义务发生时间为合同约定交付土地时间的次月起缴纳城镇土地使用税；合同未约定交付土地时间的，从合同签订的次月起缴纳。这一规定同样适用于耕地占用税的纳税义务发生时间。
特殊情况处理：
- 若耕地占用税由受让土地者缴纳，且存在合同未明确交付土地时间的情况，受让土地者应从合同签订的次月起缴纳耕地占用税。
- 对于已实际占用但未办理土地使用权证的土地，若耕地占用税由受让土地者缴纳，则受让土地者仍需按规定缴纳耕地占用税。
综上所述，招拍挂土地的耕地占用税缴纳主体需根据具体情况确定，可能由地方土地储备中心或受让土地者缴纳。但无论由谁缴纳，都应遵循相关规定的纳税义务发生时间进行缴纳。如有任何疑问或需要进一步了解相关税收政策，请直接向我咨询，我将为您提供专业的法律解答。