在诉讼过程中，若发现两个被告中有一个主体错误，原告需根据诉讼的不同阶段采取相应的措施。以下是详细的解答：

1. 若在举证期限内发现：

   • 原告可以向法院申请变更被告主体信息，提交书面申请说明情况及正确的被告信息等。
   • 法院经审查后，若认为合理，会予以准许变更。

2. 若已过举证期限：

   • 原告一般可尝试撤诉后重新起诉正确的主体。
   • 但需注意，撤诉可能影响诉讼时效等权益，因此需谨慎考量。

3. 若一审已经判决：

   • 且因被告主体错误导致判决存在问题，原告可在上诉期内上诉，说明主体错误情况，请求二审法院纠正。
   • 二审法院会全面审查案件，若认定确属主体错误，可能撤销原判并发回重审或直接改判。

此外，值得注意的是，法院在审理过程中也有依职权调查确定正确、适格被告的职责和义务，并会告知原告变更被告。若法院经审查在案证据或依职权调查后也无法确定适格被告，将按照相关法律规定进一步处理，以避免程序空转。

综上所述，原告在发现被告主体错误时，应及时采取措施，根据诉讼的不同阶段选择适当的解决方式，以确保自己的合法权益得到维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。