关于车辆挂靠费收取是否合法，这个问题涉及到多个层面，包括法律法规、政策规定以及实际的市场操作情况。以下是对这个问题的详细解答：
一、法律法规与政策规定
国家法律法规层面：
- 根据《道路运输条例》第二十二条和《道路货物运输及站场管理规定》第八条，包括个体经营者在内的任何经营主体，只要具备从事货运经营的车辆、从业人员、安全生产管理制度等条件，就可申请获取道路运输经营许可证。这表明，个体经营者是有资格独立申请道路运输经营许可证的。
- 目前，国家法律法规、国务院文件以及各类标准规范中，并没有明确禁止普通道路货物运输车辆挂靠经营的规定。
特定类型车辆的挂靠规定：
- 根据《道路旅客运输及客运站管理规定》和《国务院关于加强道路交通安全工作的意见》，长途客运车辆和道路危险品运输车辆是禁止挂靠经营的。
二、实际市场操作情况
挂靠经营的普遍存在：
- 在实际市场中，尤其是道路货运领域，挂靠经营的情况较为普遍。这主要是由于一些个体经营者可能出于获取营运资质、降低管理成本或享受某些政策优惠的考虑，选择将车辆挂靠到运输企业名下。
挂靠费用的收取：
- 挂靠企业通常会向个体经营者收取一定的挂靠费用，这可能包括管理费、保险费、年审费等各种名目的费用。这些费用的收取是否合法，关键在于是否有明确的合同约定以及是否符合相关法律法规的规定。
挂靠经营的风险与问题：
- 挂靠经营可能导致“挂而不管”的问题，即挂靠企业只收取费用而不履行相应的管理责任。这增加了道路运输的安全风险，也可能损害个体经营者的合法权益。
- 此外，挂靠经营还可能滋生非法带路、路霸路匪等问题，对道路运输秩序造成不良影响。
三、结论与建议
合法性判断：
- 从法律法规的角度来看，普通道路货物运输车辆的挂靠经营并未被明确禁止。因此，在符合相关法律法规规定的前提下，挂靠经营及挂靠费用的收取是合法的。
- 但需要注意的是，挂靠经营必须遵循自愿、平等、公平、诚实信用的原则，并应签订明确的合同来规范双方的权利和义务。
建议与措施：
- 对于个体经营者来说，在选择挂靠经营时，应仔细考察挂靠企业的信誉和管理能力，并签订详细的合同来保障自己的合法权益。
- 对于政府管理部门来说，应加强对挂靠经营的监管力度，督促挂靠企业履行安全生产主体责任，并严厉打击非法挂靠和乱收费行为。
- 同时，也可以考虑通过政策引导和市场机制来推动道路运输行业的转型升级和高质量发展，减少挂靠经营的市场需求。