车顶行李箱在加装后需要进行备案。

根据《机动车登记规定》（公安部令164号）的相关规定，小型、微型载客汽车在不改变车身主体结构且保证安全的情况下，可以加装车顶行李架。然而，这一改动需要在加装后的三十日内向登记地车辆管理所申请变更备案。如果车辆不在登记地，也可以向车辆所在地车辆管理所提出申请。

这一规定确保了车辆的改装在合法、安全的前提下进行，同时也便于车辆管理部门对车辆信息进行及时更新和管理。因此，如果您的小汽车加装了车顶行李箱，请务必在规定的时间内完成备案手续，以避免可能面临的法律风险和处罚。