生小孩的出生证明在填写时，并非只能填母亲的信息。实际上，出生医学证明通常会记录新生儿的父母双方信息，包括姓名、身份证号等。然而，在特定情况下，如果只填写了母亲的信息，这也是被允许的。

根据相关规定，出生医学证明是婴儿出生后的首要法律凭证，用于证明婴儿的出生时间、地点以及父母身份等信息。在办理出生医学证明时，原则上应填写父母双方的信息。但如果由于某些原因，如父亲信息无法确认或父亲不在场等，只填写了母亲的信息，那么这份出生证明仍然是有效的。

需要注意的是，如果出生医学证明只登记了母亲一方信息，后续在办理婴儿的相关手续，如户籍登记、疫苗接种等时，可能不需要额外提供亲子关系证明材料。然而，如果后续需要证明父子关系，则可能需要通过其他途径，如亲子鉴定等，来确认父子关系的真实性。

总的来说，虽然出生证明原则上应填写父母双方信息，但在特定情况下只填写母亲信息也是被允许的。如果您有关于出生证明办理的具体问题或疑虑，建议咨询当地的卫生保健部门或相关机构以获取更详细的信息和指导。