您好，关于您提出的“双户口注销孩子的出生证明能改吗”的问题，我为您整理了以下详细的解答：

首先，对于双重户口的处理，公安机关历来坚持“去伪存真”的原则。在调查核实后，会保留事实清楚、证据充分的户口，而注销来历不明、依据不足或违规办理的户口。当您长期使用的重复（虚假）户口被注销后，公安机关会依规出具重复（虚假）户口注销证明，以便您办理其他社会事务。

针对您提到的孩子出生证明上母亲的身份证号码与现用身份证号不一致的问题，根据相关规定，您是可以申请换发出生医学证明的。具体所需材料可能因地区而异，但通常包括以下几项：

1. 出生医学证明换发申请表：这是申请换发出生证明的基本表格，需要您填写相关信息。
2. 新生儿父母的有效身份证件及书面申请：您需要提供您和配偶的有效身份证件，以及一份书面申请，说明换发的原因和请求。
3. 亲子鉴定：由于涉及到变更母亲信息，您可能需要提供亲子鉴定证明，以确认您与孩子的亲子关系。
4. 原户籍注销的证明材料：您需要提供之前被注销的户口的证明材料，以证明您双重户口的情况，并且其中一个户口已经被注销。

请您注意，具体所需材料可能因地区政策差异而有所不同。建议您在准备材料前，先咨询当地卫生健康局或户籍所在地的派出所，了解具体的换发流程和所需材料。

总的来说，虽然双重户口的注销可能会带来一些后续问题，但只要您按照相关规定和流程办理，是可以解决这些问题的。希望我的解答能对您有所帮助。