您好，关于纳税人自行发现多缴税款超过三年是否可以退税的问题，这主要取决于相关的税收法规。

根据《中华人民共和国税收征收管理法》第五十一条的明确规定，纳税人如果发现自己多缴了税款，必须在结算缴纳税款之日起的三年内提出退税申请。在这一期限内，税务机关在查实后会及时退还多缴的税款，并可以加算银行同期存款利息。这一规定强调了三年时效的重要性，即纳税人在税款结算缴纳后的三年内享有退税的权利。

然而，如果超过了这一三年的期限，一般情况下，纳税人将无法再申请退税。这是因为税收法规设定了这一时效限制，以确保税收管理的效率和稳定性。

不过，也存在一些特殊情况。在某些极端或不可预见的情况下，如存在不可抗力等正当理由，或者纳税人能够提供充分的证据证明多缴税款并非由于自身过错所致，税务机关可能会基于公平和人道原则，对退税申请进行特殊处理。但这种情况较为罕见，且具体能否退税还需根据实际情况和税务机关的判断来确定。

因此，对于纳税人而言，及时了解自己的税务状况，定期核对税款缴纳情况是非常重要的。如果发现可能多缴了税款，应尽快在规定的期限内与税务机关取得联系，并提出退税申请。同时，也要保留好所有相关的税务文件和证据，以便在必要时提供证明。

总的来说，纳税人自行发现多缴税款超过三年，一般情况下是无法再申请退税的。但如有特殊情况或证据，建议咨询当地税务机关以获取更具体的指导和帮助。