您好，关于您提出的“超过三年能不能提请退税”的问题，我根据相关的税收法规为您详细解答如下：

根据《中华人民共和国税收征收管理法》第五十一条的明确规定，纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还。这一条款清晰界定了纳税人提请退税的时间限制，即必须在结算缴纳税款之日起的三年内提出。

同时，《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第七十八条也对此进行了补充规定，明确税务机关在发现纳税人多缴税款时，应自发现之日起10日内办理退还手续；而纳税人如发现多缴税款并要求退还，税务机关则应在接到纳税人退还申请之日起30日内查实并办理退还手续。但这一条款的执行仍然基于税收征管法第五十一条所设定的三年时间限制。

因此，如果纳税人自行发现的多缴税款已经超过了三年的期限，那么根据现行的税收法规，纳税人将无法再向税务机关提请退税。

希望这一解答能够清晰地解决您的疑问。如果您对此仍有任何不解或需要进一步的咨询，请随时联系税务部门或专业税务顾问以获取更详细的解答。