员工在持有合法病假条的情况下，一般不会被扣工资，而是按照一定比例享受病假工资。下面我将从几个方面详细解释这一结论：

1. 病假工资的法律依据：

   • 根据相关规定，员工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内，用人单位应当支付病假工资或疾病救济费。这个费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。

2. 医疗期的规定：

   • 医疗期是指员工因患病或非因工负伤停止工作治病休息，且单位不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限来确定。

3. 病假工资的发放标准：

   • 病假期间，工资是按照“日工资×病假工资比例×病假天数”的公式来发放。其中，日工资是月工资计算基数除以当月计薪日的结果，而计薪日包括国家规定的制度工作日和法定休假日。
   • 病假工资比例一般不低于本人正常工作时间工资的60%，且不能低于最低工资标准的80%。

4. 单位规章制度与劳动合同的重要性：

   • 虽然法律规定了病假工资的基本标准，但具体执行还需参考单位的规章制度和劳动合同中的相关条款。若单位有明确规定病假期间工资支付方式，且不违反法律法规，则应按此规定执行。

5. 病假条的合法性与请假流程：

   • 员工提供的病假条必须真实有效，且需符合单位的请假流程。若病假条存在伪造或未按流程请假的情况，单位有权不予认可并可能按旷工处理。

6. 单位违规扣工资的处理办法：

   • 若单位违反规定克扣病假期间工资，员工首先可以尝试与单位协商，要求单位按规定支付病假工资。
   • 若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令单位限期支付克扣的工资。
   • 员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求单位支付克扣的工资及相应的经济补偿。

综上所述，员工在持有合法病假条且遵循单位请假流程的情况下，应享有病假期间的工资待遇。若遇单位违规扣工资情况，员工应及时采取措施维护自身权益。