首先，如果对方跑路且没有上传合法取得的发票，这确实是一个比较棘手的问题，但不必过于担心，我们可以从以下几个角度来解决这个问题：

1. 法律途径追责：

   • 你可以考虑通过法律途径来追究对方的责任。如果对方是你的商业合作伙伴或者服务提供者，并且合同中明确规定了发票的提供和合法性要求，那么对方未上传合法发票可能构成违约。你可以依据合同条款向法院提起诉讼，要求对方承担违约责任，并赔偿因此给你造成的损失。

2. 税务处理：

   • 从税务角度来看，没有合法发票可能会导致你无法将相关支出作为成本进行税前扣除，从而增加税务负担。建议你及时与税务机关沟通，说明情况，并咨询是否可以采取其他替代性证明文件来作为税前扣除的依据。税务机关可能会根据你的具体情况给出相应的解决方案。

3. 内部风险管理：

   • 为了避免类似情况再次发生，你需要加强内部风险管理。建立完善的合同审核机制，确保合同中明确约定发票的提供和合法性要求。同时，加强与合作伙伴的沟通和监督，确保他们能够及时、合法地提供发票。

4. 寻求专业帮助：

   • 如果你在处理这个问题时感到困惑或无法应对，可以寻求专业律师或会计师的帮助。他们可以根据你的具体情况提供专业的法律或财务建议，帮助你更好地解决问题。

综上所述，面对对方跑路且没有上传合法取得的发票的情况，你可以通过法律途径追责、与税务机关沟通、加强内部风险管理以及寻求专业帮助等方式来解决问题。希望这些建议能对你有所帮助。如果你还有其他法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。