工伤职工与单位协商解除劳动合同，是否有经济补偿金，需根据具体情况而定。

1. 若单位提出解除，或双方协商一致解除，且单位无过错：

   • 通常情况下，用人单位与劳动者协商一致解除劳动合同，需要按照劳动者在本单位的工作年限支付经济补偿金。具体为：每满一年支付一个月工资，半年以上不满一年按一年计算，不满半年支付半个月工资。

2. 若工伤职工主动提出解除劳动合同，且单位无过错：

   • 在这种情况下，单位通常无需支付经济补偿金。但工伤职工依然可以享受一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等工伤保险待遇，这些待遇的支付标准和方式由省级政府规定。

3. 若工伤职工因严重违反单位规章制度等自身过错被解除：

   • 这种情况下，工伤职工通常无法获得经济补偿金。

综上所述，工伤职工与单位协商解除劳动合同时，是否有经济补偿金取决于解除合同的提出方、解除原因以及工伤职工的具体情况。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。