在违建查处过程中，如果违法建筑灭失，案件是否可以终结，这主要取决于相关的法律法规以及具体的执法实践。以下是对此问题的详细分析：
首先，明确结论：
违法建筑灭失后，案件是否终结需根据具体情况判断，通常需考虑违法建筑的灭失原因、查处阶段、以及是否已采取相关法律措施等因素。
接下来，分类讨论：
违法建筑自然灭失：
- 如果违法建筑因自然灾害（如地震、洪水等）或其他不可抗力因素导致灭失，且相关执法部门尚未作出处罚决定，那么案件可能会因标的物的消失而自然终结。但执法部门仍需记录相关情况，并可能根据法律法规进行后续处理，如注销违法建筑的相关登记等。
违法建筑被拆除：
- 如果违法建筑已被执法部门依法拆除，那么案件通常会随着拆除行为的完成而终结。但拆除前，执法部门需按照法定程序进行公告、催告、作出拆除决定等，并确保拆除行为的合法性。拆除后，还需进行相关的善后工作，如清理现场、恢复土地原状等。
违法建筑灭失但已采取法律措施：
- 如果在违法建筑灭失前，执法部门已经对其采取了法律措施，如作出罚款决定、责令改正等，那么即使违法建筑灭失，案件也并未完全终结。执法部门仍需继续执行已作出的法律决定，并可能根据法律法规对违法建筑的相关责任人进行追责。
此外，还需考虑其他因素：
- 法律法规的变化：随着法律法规的不断完善，对违法建筑的处理方式也可能发生变化。因此，在处理违法建筑灭失后的案件时，需密切关注相关法律法规的更新和变化。
- 执法实践的差异：不同地区的执法实践可能存在差异。在处理具体案件时，需结合当地的执法实践和实际情况进行判断。
最后，给出建议：
如果您面临类似情况，建议及时咨询当地执法部门或专业律师，以了解具体的法律法规和执法实践，并根据实际情况采取相应的法律措施。