关于交通运输综合执法查扣非法营运三轮车、四轮车的措施，我可以从以下几个方面进行详细解答：
一、查扣措施的法律依据
交通运输综合执法部门在查扣非法营运三轮车、四轮车时，主要依据的是《中华人民共和国道路交通安全法》及相关地方性法规。这些法律法规赋予了执法部门对道路交通违法行为进行查处和纠正的权力。
二、查扣的具体措施
现场检查与取证：
- 执法人员会对涉嫌非法营运的三轮车、四轮车进行现场检查，包括查看车辆状况、询问驾驶员相关情况等。
- 执法人员会收集相关证据，如拍照、录像等，以确保后续处理的合法性。
暂扣车辆：
- 如果确认车辆存在非法营运行为，执法人员有权暂扣车辆，并将其移至指定的停车场所。
- 暂扣车辆期间，执法人员会按照法定程序对车辆进行处理，包括调查取证、制作法律文书等。
处罚决定：
- 根据调查结果，执法部门会对非法营运行为作出处罚决定，包括罚款、警告等。
- 对于情节严重的非法营运行为，还可能面临更严厉的处罚，如吊销驾驶证、没收违法所得等。
车辆返还与处置：
- 如果车主在规定时间内接受了处罚并履行了相关义务，执法部门会按照程序返还暂扣的车辆。
- 对于无人认领或无法联系到车主的车辆，执法部门会依法进行处置，如拍卖、报废等。
三、相关法律依据
- 《中华人民共和国道路交通安全法》第九十九条：对于未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，并可以并处十五日以下拘留。
- （地方性法规）：各地根据实际情况制定的关于非法营运的具体处罚措施和规定。
四、法律建议
- 遵守法律法规：建议三轮车、四轮车的车主和驾驶员严格遵守道路交通法律法规，不要从事非法营运活动。
- 了解处罚措施：对于可能面临的处罚措施，车主和驾驶员应该提前了解并做好准备。
- 配合执法工作：在遇到执法检查时，车主和驾驶员应该积极配合执法人员的工作，如实提供相关信息和证据。
综上所述，交通运输综合执法部门在查扣非法营运三轮车、四轮车时，会依据相关法律法规采取一系列措施。车主和驾驶员应该遵守法律法规，避免从事非法营运活动，以免面临不必要的处罚。如果有任何疑问或需要帮助，请随时向我咨询。