在规划区的违建，并不直接归属于农业农村局管辖，而是由多个政府部门共同管理。具体分析如下：

1. 乡镇人民政府的管辖权：

   • 在乡、村庄规划区内，未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定进行建设的，由乡镇人民政府负责查处工作。乡镇人民政府有权责令停止建设、限期改正，并可在逾期不改正的情况下组织拆除违法建筑。

2. 自然资源部门的管辖权：

   • 自然资源部门负责土地资源和城乡规划的管理工作。对于农村违建中未经批准非法占用土地的情况，自然资源部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法土地上新建的建筑物和其他设施。

3. 农业农村部门的角色：

   • 农业农村部门主要负责农村宅基地的管理和监督，针对违反农村宅基地管理规定的违建行为具有管理职责。然而，其管辖范围相对具体，主要集中在宅基地的使用和建设情况上，而非广义上的规划区违建。

4. 综合管理与举报途径：

   • 在发现规划区内的违建情况时，应首先判断违建的具体位置和性质，然后根据所属规划区类型向对应的政府部门反映和举报。乡、村庄规划区内的违建主要由乡镇人民政府处理，而涉及土地资源和城乡规划管理的违建则由自然资源部门负责。

综上所述，规划区内的违建问题并非仅由农业农村局管辖，而是涉及多个政府部门的综合管理。在处理此类问题时，应根据违建的具体情况和所在区域，向对应的政府部门反映和举报，以确保问题得到及时有效的处理。如果您有具体的违建问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会为您提供专业的法律帮助。