当面对诈骗案件中证据不足的情况时，司法机关会依据法律程序，在不同阶段进行相应的处理，以确保案件的公正性和当事人的合法权益。以下是对此问题的详细解答：
一、侦查阶段
补充侦查：
- 公安机关在侦查过程中，若发现现有证据不足以证明犯罪嫌疑人构成诈骗罪，会进一步展开调查。这可能包括重新询问证人、查找新的物证、深入分析电子数据等，以全面收集与案件相关的各种证据。
撤销案件：
- 若经过多次补充侦查后，公安机关仍然认为证据无法达到立案标准，即无法证明有犯罪事实需追究刑事责任，那么将作出撤销案件的决定。此时，被采取强制措施的犯罪嫌疑人将被立即释放，并收到释放证明。
二、审查起诉阶段
退回补充侦查：
- 人民检察院在审查公安机关移送起诉的诈骗案件时，若发现证据不足，不符合起诉条件，可以将案件退回公安机关补充侦查。补充侦查的次数限制为两次，每次期限为一个月。公安机关补充侦查完毕后，人民检察院将重新计算审查起诉期限。
不起诉决定：
- 对于经过一次或两次退回补充侦查后，人民检察院仍然认为证据不足、不符合起诉条件的案件，将作出不起诉决定。这种决定被称为“存疑不起诉”，意味着因证据存疑而无法认定犯罪嫌疑人构成犯罪并需追究刑事责任。在特定情况下，人民检察院也可能建议公安机关撤销案件。
三、审判阶段
建议补充证据或延期审理：
- 在法庭审理过程中，若发现案件证据不足，人民法院可以建议人民检察院补充证据，或者决定延期审理。这样，人民检察院可以在规定时间内补充证据后再恢复审理。
无罪判决：
- 若经审理后，人民法院认为证据不足，不能认定被告人有罪，将依据“疑罪从无”的原则，作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。这一原则体现了刑事诉讼中对被告人权益的保护，即在证据不确实、不充分的情况下，应作出有利于被告人的认定。
四、被告人的权利保障与建议
权利保障：在整个刑事诉讼过程中，司法机关应严格遵循法定程序，确保被告人的合法权益不受侵犯。被告人有权了解案件进展情况，对司法机关的处理决定有异议时，可以通过合法途径提出申诉或上诉。
积极寻求法律援助：被告人面临证据不足的指控时，应积极寻求专业律师的法律援助，了解自身权利和可行的法律途径。
配合司法机关调查：被告人应积极配合司法机关的调查工作，提供自己掌握的信息和线索，以协助查明案件事实。
保持冷静与理智：面对指控，被告人应保持冷静与理智，避免情绪化行为影响案件处理。
综上所述，当诈骗案件面临证据不足时，司法机关将依法进行补充侦查、审查起诉或审判，并可能作出撤销案件、不起诉决定或无罪判决。被告人应积极配合调查工作，并寻求法律援助以维护自身合法权益。