结论前置：轻伤二级案件在法院调解后，大部分情况下仍会留下案底，但调解结果可以作为量刑时从宽处理的一个考虑因素。具体是否留下案底，取决于案件是否进入刑事诉讼程序、调解的时机与性质，以及当地的法律规定和司法实践。

详细分析：

1. 刑事诉讼程序与案底：

   • 故意伤害致人轻伤二级已达到故意伤害罪的立案标准。一旦公安机关立案，即便后续双方达成调解，案件记录仍会存在于公安机关的系统中。这是因为犯罪行为一旦发生并被立案，就会作为刑事案件在司法程序中留下痕迹。
   • 如果案件进入刑事诉讼程序，无论最终判决如何，都可能在个人的法律记录中留下“案底”。调解虽可作为量刑的考虑因素，但不影响案件本身的记录。

2. 调解的作用与限制：

   • 调解在刑事诉讼过程中是一个重要的环节，它有助于化解矛盾，促进双方和解。受害者的谅解在刑事诉讼过程中是一个重要的酌定从轻处罚情节。法官在量刑时会考虑这一因素，可能对犯罪嫌疑人从轻、减轻处罚，甚至适用缓刑。
   • 然而，调解并不意味着可以撤销案件或不被认定为犯罪。案底是由法院审判后认定有罪的相关记录，调解不能改变这一事实。

3. 特殊情况下的不起诉决定：

   • 在特殊情况下，如果犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。例如，未成年犯罪嫌疑人符合附条件不起诉的相关规定，经过考察期后检察院决定不起诉的，这种情况下不会留下犯罪记录。
   • 此外，如果派出所未将案件作为刑事案件立案，而是作为治安案件处理，并且经调解成功后可能不移送检察机关，那么也可能不会留下案底。但这并不意味着犯罪行为被忽视或未发生，而是案件处理流程上的差异。

4. 案底的影响：

   • 案底的存在对个人的社会评价、就业、出国等方面都可能产生不利影响。在政审环节，案底往往成为限制个人发展的一个重要因素。
   • 因此，即使案件经过调解，也应认真对待，尽可能减轻对个人的不利影响。

建议与对策：

• 如果您或您身边的人涉及轻伤二级案件，并希望了解具体的法律后果和应对策略，可以直接向我咨询。我会根据具体情况提供专业的法律意见和指导，帮助您更好地维护自己的合法权益。
• 在处理此类案件时，应积极配合司法机关的工作，如实陈述事实，提供相关证据。同时，也可以尝试与受害者进行沟通，争取达成和解，以减轻可能的刑事责任。

总结：轻伤二级案件在法院调解后，是否留案底并不是绝对的。它取决于案件的性质、处理流程以及法律适用。虽然调解可以作为量刑时从宽处理的一个考虑因素，但不能完全消除刑事责任和案底记录。因此，在处理此类案件时，应充分了解相关法律法规和程序规定，以确保合法权益得到妥善保护。