免于起诉是否会有案底，需根据具体情况和法律规定来判断。以下是对这一问题的详细分析：

一、免于起诉的基本概念

免于起诉，在现行法律中更准确地表述为“不起诉”，它指的是人民检察院在审查起诉后，决定不将案件移送人民法院审判而终止诉讼的决定。不起诉并不意味着行为人没有实施过违法行为，而是基于法律的规定或案件的具体情况，认为不需要或不宜对行为人进行刑事审判。

二、不同免于起诉情形的法律分析

1. 法定不起诉

   • 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条及第一百七十七条第一款。
   • 情形描述：包括情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚等六种法定情形。
   • 案底情况：由于本质上不认为是犯罪或者不追究刑事责任，因此这种情况下不会留下案底。

2. 酌定不起诉（相对不起诉）

   • 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第二款。
   • 情形描述：犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。
   • 案底情况：虽然酌定不起诉没有经过法院审判宣告有罪，但其实质是认定犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，只是由于情节轻微等原因而未被起诉。因此，在司法实践中，部分地区可能会认为行为人有违法犯罪的相关记录，这可能对行为人产生一定影响，如职业准入、社会信用评价等。但从严格意义上讲，没有法院的有罪判决，不构成正式的犯罪记录。不过，为了保险起见，我们仍需认为这种情况下可能留有“案底”。

3. 证据不足不起诉

   • 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条第四款。
   • 情形描述：对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
   • 案底情况：现有证据无法证明犯罪嫌疑人有罪，因此不能认定犯罪嫌疑人构成犯罪，不会留下案底。但需要注意的是，如果后续有新证据出现，且证明犯罪嫌疑人确实构成犯罪，那么可能会重新启动诉讼程序。

三、其他相关情况

1. 公安机关的记录：即使检察院作出不起诉决定，如果之前案件经过了公安机关的侦查，并在侦查过程中产生了相关记录（如拘留、取保候审等），这些记录在公安机关是可能会留存的。但这些记录并不等同于正式的犯罪记录，它们更多是作为案件处理过程的记录而存在。

2. 未成年人犯罪记录的封存：对于未成年人犯罪，如果检察院作出不起诉决定，其犯罪记录会被封存。这意味着，在一般情况下，这些记录不会向任何单位和个人提供。但在司法机关办案需要或有关单位根据国家规定进行查询时，仍可以查询到相关记录。

四、综合建议

1. 了解具体情形：如果你或你认识的人面临免于起诉的情况，首先需要了解具体是哪种情形的不起诉。这有助于你更准确地判断是否会留下案底以及可能产生的影响。

2. 咨询法律专业人士：虽然我已经为你提供了详细的分析和建议，但每个案件的具体情况都是独特的。因此，如果你有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更准确的解答和帮助。

3. 关注后续影响：即使免于起诉没有留下正式的犯罪记录，也可能对个人的名誉、就业、社会评价等方面产生一定影响。因此，在面对可能的刑事诉讼时，应充分了解自身权益及可能面临的法律后果，并做好相应的准备和应对。