结论：交通事故免诉后，一般情况下不会留下案底。但具体是否留有案底，还需根据事故的性质和是否涉及刑事犯罪来判断。
详细分析：
“免诉”与“案底”的定义：
- “免诉”通常指的是在刑事诉讼过程中，由于某种原因（如情节轻微、证据不足等），检察机关决定不对犯罪嫌疑人提起公诉。
- “案底”则是指个人因犯罪被判处刑罚后，在公安机关留下的犯罪记录。这一记录对个人今后的生活，如就业某些特定行业、出国等方面可能产生影响。
交通事故免诉的一般情况：
- 如果交通事故仅涉及民事赔偿问题，且双方能够协商解决或通过民事诉讼达成调解、判决，那么即使案件进入诉讼程序，也通常不会涉及刑事犯罪，因此不会留下案底。
- 在这种情况下，“免诉”可能指的是双方通过和解、调解等方式解决了争议，无需经过法院的正式审判，自然也不会产生犯罪记录。
交通事故涉及刑事犯罪的特殊情况：
- 如果交通事故的情节严重，构成交通肇事罪等刑事犯罪，例如肇事者存在酒后驾车、肇事逃逸等恶劣行为，并且这些行为被检察机关认定构成犯罪，但出于某种原因（如情节轻微、认罪态度好等）决定免诉，那么虽然免诉，但肇事者的行为已经触犯了刑法，其犯罪记录可能会被记录在个人的犯罪档案中，不过，免诉通常意味着不会留下刑罚执行的记录，但犯罪事实本身可能仍会被记录。但严格意义上讲，只要构成犯罪，即便免诉也会有犯罪记录，只是没有刑罚执行记录。不过，在实务中，若最终未进入审判程序并定罪，一般对外查询不会显示有犯罪记录。
- 另一种情况是，如果交通事故案件最初被作为刑事案件立案侦查，但经过调查后发现不构成犯罪或证据不足，检察机关决定免诉，那么这种情况下也不会留下案底，因为根本没有构成犯罪。
法律建议与指导：
- 在处理交通事故时，建议双方保持冷静，理性协商，尽量通过和解或调解的方式解决争议，以避免不必要的法律纠纷和可能的刑事责任。
- 如果无法达成一致，可以通过法律途径寻求解决方案，但应确保自己的行为不违反法律法规，避免产生不必要的法律责任和后果。
- 如果对交通事故的处理结果有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律风险。
总结：交通事故免诉后是否留下案底，取决于事故的性质和是否涉及刑事犯罪。在一般情况下，如果仅涉及民事赔偿问题且双方能够协商解决，那么不会留下案底。但如果涉及刑事犯罪，即使免诉，也可能留下犯罪记录（不过严格定罪才会留有案底，免诉实务中一般对外不显示犯罪记录）。因此，在处理交通事故时，应遵守法律法规，理性应对，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。