针对员工旷工一天的处理问题，这确实是一个涉及劳动法规定和公司管理制度的重要议题。首先，我们需要明确的是，员工旷工一天，公司有权不支付该员工当天的工资，因为员工没有提供正常的劳动。但是，公司不能因此进行额外的惩罚性罚款，比如“旷一罚三”这样的做法。

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这意味着，公司只能扣除员工旷工当天的工资，而不能额外扣除其他正常工作日的工资。超出旷工当天应扣除的工资部分，属于对劳动者工资的任意扣减，这是违反法律规定的。

二、公司管理制度

当然，公司有权制定自己的管理制度，包括对旷工行为的处理规定。但是，这些规定必须符合法律法规的要求，不能侵犯员工的合法权益。如果公司规定旷工一天扣三天工资，这样的规定在司法实践中通常会被认定为无效，因为它违反了劳动法的相关规定。

三、建议处理方式

1. 沟通解释：当员工旷工时，公司应该首先与员工进行沟通，了解旷工的原因，并解释公司的管理制度和劳动法规定。

2. 扣除当天工资：根据员工旷工的事实，公司可以扣除该员工当天的工资，这是合法且合理的。

3. 避免额外罚款：公司应避免对员工进行额外的惩罚性罚款，如“旷一罚三”等，这样的做法不仅违反法律，也可能引发员工的不满和纠纷。

4. 完善管理制度：公司可以借此机会完善自己的管理制度，明确旷工行为的处理方式和程序，确保既符合法律法规的要求，又能有效维护公司的正常运营秩序。

四、员工权益保护

如果员工认为公司的处理方式违反了法律法规或侵犯了自己的合法权益，员工有权向劳动部门投诉举报，维护自己的合法权益。

综上所述，员工旷工一天，公司应扣除该员工当天的工资，但不得进行额外的惩罚性罚款。公司应完善自己的管理制度，确保既符合法律法规的要求，又能有效维护公司的正常运营秩序。同时，员工也应了解自己的合法权益，并在必要时采取措施进行维护。