关于按摩店被抓后的处罚问题，这确实是一个涉及多方面法律因素的复杂情况。以下是我为您详细梳理的解答：
一、合法经营下的情况
如果按摩店是合法经营，且所有服务内容都严格遵守相关法律法规，那么即使因误会等原因被警方调查，只要经过核实确认无误，店铺是不会受到任何处罚的。警方会解除相关措施，并对情况进行说明解释，确保店铺的正常运营不受影响。
二、涉及违法行为的处罚
一般治安管理处罚：
- 如果按摩店存在轻微违反治安管理规定的行为，比如未按规定登记从业人员信息、场所消防设施不全等，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，可能会面临警告或罚款等处罚。罚款的幅度会根据具体违法行为的性质和严重程度而定，一般从几百元到数千元不等。
- 如果按摩店存在打“擦边球”的色情暗示或轻微色情服务行为，但尚未达到组织、强迫卖淫等严重犯罪程度，那么将按照《中华人民共和国治安管理处罚法》第六十六条以“卖淫、嫖娼”论处，处十日以上十五日以下拘留，并可并处五千元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款。在公共场所拉客招嫖的，同样会受到这样的处罚。
严重刑事处罚：
- 如果按摩店组织他人卖淫，那么将触犯《中华人民共和国刑法》第三百五十八条，构成组织卖淫罪。根据犯罪情节的严重程度，将处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节严重的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。如果组织、强迫未成年人卖淫，则会依照前款规定从重处罚。
- 如果为组织卖淫的人招募、运送人员或有其他协助组织他人卖淫行为的，那么将构成协助组织卖淫罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将处五年以下有期徒刑，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
- 如果按摩店容留、介绍他人卖淫，那么将构成容留、介绍卖淫罪，根据《中华人民共和国刑法》第三百五十九条，将处五年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节严重的，处五年以上有期徒刑，并处罚金。如果引诱不满十四周岁的幼女卖淫的，处五年以上有期徒刑，并处罚金。
三、法人可能承担的责任
除了上述针对按摩店的处罚外，如果法人（即店铺的负责人或经营者）明知并参与、组织、支持或容留违法犯罪活动，那么法人也可能需要承担相应的法律责任。这包括行政责任（如罚款、停业整顿等）、民事责任（如赔偿损失等）以及刑事责任（如有期徒刑、罚金等）。
四、建议与应对措施
- 严格遵守法律法规：按摩店经营者应确保店铺的所有经营活动都严格遵守相关法律法规，避免任何违法违规行为的发生。
- 加强内部管理：建立健全的内部管理制度，加强对员工的培训和教育，提高员工的法律意识和职业道德水平。
- 积极配合调查：如果店铺因某种原因被警方调查，经营者应积极配合调查工作，提供必要的证据和资料，以便尽快查明事实真相。
- 寻求法律帮助：如果面临法律问题或纠纷，经营者应及时咨询专业律师，以便更好地了解相关法律规定并寻求合适的解决方案。
综上所述，按摩店被抓后的处罚方式取决于违法行为的性质和严重程度。因此，我建议按摩店经营者严格遵守相关法律法规，确保合法合规经营，以避免不必要的法律风险和损失。