业主装修时将下水管道包起来是否合法，需视具体情况而定，主要取决于是否违反相关法律法规、物业管理规定以及是否影响其他业主权益。以下从不同角度进行分析：
法律法规层面：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，业主对其建筑物专有部分享有占有、使用、收益和处分的权利。然而，这一权利的行使不得危及建筑物的安全，不得损害其他业主的合法权益。下水管道作为建筑物内的公共设施，其维护和管理通常属于物业公司的职责范围，或者由业主共同负责。
- 如果业主在装修时将下水管道包起来，且这种行为没有改变管道的结构、功能或影响其正常使用，同时也没有对建筑物的安全构成威胁，那么这种行为在法律法规上可能是允许的。
物业管理规定层面：
- 物业公司通常会制定一系列的装修管理规定，以规范业主的装修行为，确保建筑物的安全和美观。这些规定可能包括禁止对公共设施进行改动或封闭等。
- 如果业主在装修时违反了物业公司的装修管理规定，将下水管道包起来，那么物业公司有权要求业主恢复原状，甚至可能对业主进行处罚。
影响其他业主权益层面：
- 下水管道作为公共设施，其正常使用关系到整个建筑物的排水系统。如果业主在装修时将下水管道包起来，且这种行为影响了管道的通风、检修或排水功能，那么这种行为就可能损害了其他业主的合法权益。
- 在这种情况下，其他业主有权要求该业主停止侵权行为，并恢复下水管道的原状。
法律建议：
- 在装修前，业主应仔细阅读物业公司的装修管理规定，了解哪些行为是允许的，哪些行为是禁止的。
- 如果业主打算对下水管道进行改动或封闭，应事先与物业公司进行沟通，并获得物业公司的书面同意。
- 在装修过程中，业主应确保自己的行为不会损害其他业主的合法权益，也不会对建筑物的安全构成威胁。
可能法律后果：
- 如果业主未经允许擅自将下水管道包起来，且这种行为违反了法律法规、物业管理规定或损害了其他业主的权益，那么业主可能面临恢复原状、赔偿损失等法律责任。
- 在严重情况下，如果业主的行为构成了违法行为，如破坏公共设施等，还可能面临行政处罚或刑事责任。
综上所述，业主在装修时将下水管道包起来是否合法，需根据具体情况进行判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。