代发工资超过5000元本身并不直接产生法律后果，但可能涉及税务申报、个人所得税缴纳以及可能的法律风险，具体取决于代发工资的性质、来源以及是否依法进行了税务处理。以下从不同角度为您详细分析：

1. 税务申报与缴纳：

   • 根据我国税法规定，个人取得工资、薪金所得，应依法缴纳个人所得税。代发工资超过5000元，意味着该部分收入可能达到或超过个人所得税的起征点（目前为每月5000元，但具体起征点可能随政策调整而变化），因此需要依法进行税务申报并缴纳相应的税款。
   • 如果代发工资是合法收入，且已经依法进行了税务申报和缴纳，那么就不会产生法律后果。但如果未依法申报或缴纳税款，则可能面临税务机关的处罚，包括补缴税款、滞纳金以及罚款等。

2. 法律风险与合规性：

   • 代发工资的行为本身需要合法合规。如果代发工资涉及非法所得（如贪污、受贿、盗窃等违法犯罪活动的所得），或者代发工资的行为本身违反了法律法规（如未经许可从事金融业务、洗钱等），那么无论金额大小，都可能面临严重的法律后果。
   • 此外，如果代发工资的行为涉及虚假申报、逃避税务监管等违法行为，也可能受到法律的制裁。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 对于企业或个人而言，如果需要代发工资，应确保该行为合法合规，并依法进行税务申报和缴纳。
   • 如果代发工资的金额较大或涉及多个收款人，建议咨询专业的税务顾问或律师，以确保操作的合法性和合规性。
   • 同时，应保留好相关的税务申报和缴纳记录，以备税务机关的查询和检查。

举例说明：

• 假设某公司委托另一家公司代发其员工的工资，且代发工资的金额超过了5000元。如果该公司已经依法进行了税务申报和缴纳，且代发工资的行为本身合法合规，那么就不会产生法律后果。
• 但如果该公司未依法申报或缴纳税款，或者代发工资的行为涉及非法所得或违法行为，那么就可能面临税务机关的处罚或法律制裁。

建议：

• 如果您涉及代发工资的情况，请务必确保该行为合法合规，并依法进行税务申报和缴纳。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。