结论前置：自离（自动离职）扣工资是否违法，不能一概而论，需根据具体情况判断。一般情况下，用人单位不得无故克扣劳动者工资；但在特殊情况下，如劳动者自离给用人单位造成经济损失或违反劳动合同约定，用人单位有权依法扣除部分工资作为赔偿或违约金。
一、一般情况下，自离扣工资违法
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也明确，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
分析：
- 在正常情况下，劳动者自动离职并不构成用人单位克扣其工资的理由。只要劳动者提供了正常劳动，无论其是主动离职还是被动离职，用人单位都应按照实际提供劳动的天数和双方约定的工资标准支付相应工资。
- 如果用人单位以劳动者自离为由，无故克扣其工资，那么这种行为是违法的。劳动者有权要求用人单位足额支付工资，并可以通过法律途径维护自己的权益。
二、特殊情况下，自离扣工资可能合法
给用人单位造成损失的情况：
- 法律依据：
- 《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第九十条也规定，劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
- 分析：
- 若劳动者自离导致用人单位遭受经济损失，如业务中断、资料丢失等，用人单位有权要求劳动者赔偿。在此情况下，扣除部分工资作为赔偿可能是合法的，但需确保扣除金额在法律规定的范围内，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
违反劳动合同约定或规章制度的情况：
- 法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第二十九条规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。若劳动合同或规章制度中明确规定了离职程序及违约责任，且这些规定已告知劳动者，则劳动者自离可能构成违约。
- 分析：
- 若劳动者违反劳动合同或规章制度中的离职规定，用人单位可根据合同约定或规章制度对劳动者进行相应处理，包括扣除一定工资作为违约金。但此扣除同样需遵守法律规定的限额，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
三、劳动者如何维权
如果用人单位以劳动者自离为由，无故克扣其工资，劳动者可以通过以下途径来维护自身权益：
- 协商：首先尝试与用人单位进行协商，要求足额支付工资。
- 投诉：若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位改正。
- 仲裁与诉讼：如果投诉仍未解决问题，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付工资及相应的经济补偿。对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
四、建议与总结
为避免因自离扣工资引发的纠纷，建议用人单位和劳动者采取以下措施：
- 用人单位应依法与劳动者订立书面劳动合同，并明确约定解除劳动合同的条件、程序和违约责任。
- 劳动者在离职时，应遵守劳动合同和用人单位的规章制度，办理好离职手续，减少因自离给用人单位造成的损失。
- 双方应加强沟通和协商，及时解决劳动争议，共同维护劳动关系的和谐稳定。
综上所述，自离扣工资并非一概而论地合法或不合法，而是需要根据具体情况来判断。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。