工作超过12个小时，在大多数情况下是违法的，但也有一些特殊情况可能不构成违法。以下从法律规定、特殊情况及劳动者权益保护三个维度为你详细分析：
一、法律规定层面
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这一规定明确了标准工时的上限，旨在保护劳动者的休息权益。同时，《劳动法》第四十一条进一步指出，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
从法律条文来看，未经法定程序批准或超出法定时长的12小时工作制，直接违反了劳动法的强制性规定。例如，如果用人单位未与劳动者协商，就单方面安排劳动者每天工作12小时，且没有合理的休息安排、调休、补休措施，也未按照法律规定支付加班工资，这种做法显然是违法的。
二、特殊情况下的合法性边界
尽管存在上述限制，但在特定情形下可能允许延长工作时间：
紧急生产任务：当企业面临突发订单、设备抢修等紧急情况，需通过民主程序（如职工代表大会）制定临时加班方案，且必须支付不低于工资150%的加班费。但即便如此，也需遵守“每日最长11小时、每月最多36小时”的法定红线，任何突破该界限的安排均构成违法。
特殊行业豁免：交通运输、渔业捕捞等行业可申请不定时工作制审批，但需确保员工每周至少休息一天，并通过轮班制分散连续作业时长。例如，对于某些需要24小时值班的岗位，如医院的护士、消防队的消防员等，他们的工作时间可能会超过12小时，但这是基于行业的特殊性和公共利益的需要，且通常会有相应的补休或加班费补偿。不过，这些例外情形仍需遵守法定红线，不能无限制地延长工作时间。
协商一致原则：所有延长工时安排必须与工会或员工达成书面协议，明确加班期限、补偿标准及健康保障措施。如果劳动者自愿加班，且用人单位与劳动者就加班事宜达成了书面协议，并按照法律规定支付了加班费，那么这种加班行为可能是合法的。但即使如此，每日工作时间也不应超过法定上限。
三、劳动者权益保护
若遭遇超时用工，劳动者可通过以下方式维护权益：
证据固定：保存考勤记录、工资条、加班通知等书面材料，必要时通过录音录像留存现场证据。这些证据将有助于你在后续的维权过程中证明自己的加班事实。
内部协商：优先向人力资源部门反映问题，要求调整工时并补发加班费。很多时候，通过内部协商可以更快地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
行政投诉：向当地劳动保障监察机构提交举报材料，执法部门将依法开展调查并要求企业整改。如果内部协商无果，你可以向劳动保障监察机构投诉，他们会依法对用人单位进行调查和处理。
司法救济：对仲裁结果不服的，可在法定期限内向法院提起诉讼，主张未付加班费等经济赔偿。如果行政投诉也无法解决问题，你还可以通过法律途径来维护自己的权益。
总结来说，工作超过12个小时是否违法，需根据具体情况判断。在任何情况下，用人单位都应严格遵守劳动法的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。如果你遇到了超时用工的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。