当遇到工伤医疗纠纷时，职工可以依次通过以下部门或途径来维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商解决

   • 重要性：协商解决是处理工伤纠纷最快捷、最经济的方式。职工应主动与用人单位沟通，明确表达自身诉求，如医疗费用、停工留薪期工资、伤残补助金等，争取达成双方都能接受的解决方案。
   • 建议：在协商过程中，职工可以保留好相关证据，如劳动合同、工资单、医疗记录等，以便在需要时提供有力支持。

2. 向劳动保障行政部门（人力资源和社会保障局/社会保险行政部门）申请工伤认定

   • 职责：劳动保障行政部门负责受理工伤认定申请，对事故伤害进行调查核实，并作出是否认定为工伤的决定。
   • 申请流程：
     • 职工发生事故伤害或被诊断为职业病后，用人单位应在30日内向统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。特殊情况可适当延长。
     • 若用人单位未按规定时间提出申请，工伤职工或其直系亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或被诊断为职业病之日起1年内直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出申请。
   • 所需材料：包括工伤认定申请表、劳动关系证明材料、医疗诊断证明或职业病诊断证明书等。
   • 后续行动：对认定结果不服，职工可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

3. 向劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定

   • 职责：劳动能力鉴定委员会负责对工伤职工的劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度进行等级鉴定。
   • 申请流程：
     • 工伤职工经治疗伤情相对稳定后，若存在残疾或影响劳动能力，应及时向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请。
   • 所需材料：通常包括劳动能力鉴定申请表、工伤认定决定书、有效的诊断证明及相关病历材料等。
   • 后续行动：对初次鉴定结论不服，职工可在规定时间内向省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请；伤残情况发生变化时，可申请复查鉴定。

4. 向劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁

   • 职责：若因工伤待遇（如医疗费、停工留薪期工资、伤残补助金等）与用人单位发生争议，且无法通过协商解决，职工可向劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 申请流程：
     • 职工应自知道或应当知道权利被侵害之日起1年内向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提出书面申请。
   • 所需材料：包括仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明、工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书等相关证据材料。
   • 处理结果：仲裁委员会依法裁决，当事人对裁决不服的，可在收到裁决书之日起15日内向人民法院提起诉讼。

5. 向人民法院提起诉讼

   • 职责：若对劳动仲裁结果不满意或对工伤认定决定有异议，职工可通过行政诉讼或民事诉讼维权。行政诉讼针对劳动行政部门的具体行政行为（如工伤认定）；民事诉讼则处理工伤待遇赔偿等民事争议。
   • 注意事项：职工需在法定期限内起诉，遵循举证规则，必要时可寻求我的进一步法律帮助。

6. 利用相关服务热线进行咨询或投诉

   • 12333：人力资源和社会保障局服务热线，提供工伤处理流程咨询或投诉服务。
   • 12345：市长服务热线，用于反馈和投诉工伤相关问题。
   • 12348：免费法律服务热线，提供免费法律咨询。

在处理工伤医疗纠纷过程中，职工还需注意以下几点：

• 保留证据：务必妥善保留劳动合同、医疗诊断证明、工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书等相关证据材料。
• 及时申请：注意各申请流程的时效性要求，确保在规定时间内提出申请或复议。
• 了解法律法规：在处理工伤问题时，建议了解相关法律法规，以便更好地维护自己的权益。

希望以上信息能对你有所帮助。如果你在处理工伤医疗纠纷过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供详细的法律建议和帮助。